Os Centros da Fundação Aprender são órgãos componentes de sua Estrutura Orgânica, por meio dos quais são operacionalizadas, difundidas e irradiadas todas as atividades educacionais, culturais, cientificas e tecnológicas desta Instituição.Três Centros fazem a composição sistêmica do campo de ação da Fundação Aprender:
Os Centros serão regulamentados através de Regimentos Internos próprios, elaborados pelos coordenadores e submetidos à aprovação do Conselho de Curadores. Estão sendo organizados e instalados de forma gradual e seqüencial e todos obedecerão na sua concepção, estruturação e implantação, a LDB – Lei de Diretrizes e Bases da Educação Nacional, às Resoluções Normativas dos Conselhos Federal e Estadual de Educação, às Portarias e Resoluções do Ministério da Educação e da Secretaria de Estado da Educação, do Ministério da Ciência e Tecnologia e demais procedimentos aplicáveis da legislação vigente.